在线联系

深圳市今发展生物科技有限公司

地址:深圳市龙华新区龙华街道龙观大道1号望成大厦六楼621

电话:service@geneups.com
您当前的位置:首页 > 服务 > miRNA靶基因预测与鉴定
miRNA靶基因预测与鉴定

miRNA靶基因鉴定

靶基因鉴定是阐明miRNA作用机制的关键,如何预测和验证靶基因是所有miRNA研究工作者面临并需要解决的难题。Geneup公司使用多种在线工具免费为您进行miRNAs靶基因的预测,并结合现有各种基因数据库与miRNAs功能数据库,为您提供最可靠的判断。所有miRNA靶基因的预测结果必须通过各种实验手段进行验证,主要包括:

Ø  靶基因3’ -UTR荧光素酶报告实验;

Ø  蛋白质水平验证miRNA过表达或抑制表达与靶基因蛋白水平的关系。

(一)靶基因3-UTR荧光素酶报告基因载体

Geneup公司利用两种荧光素酶报告基因检测系统,构建miRNA候选靶基因3`-UTR的载体,通过萤光素酶活性检测,确定miRNA与靶基因3`-UTR的关系。

1.单荧光素酶(F.Luc)报告载体pFLuc载体图谱:

 

pFLuc.bmp

载体特点:

Ø  SV40启动子驱动萤火虫荧光素酶报告基因(F.Luc)的表达;

Ø  氨苄抗性筛选基因;

Ø  通过EcoRI- XbaI双酶切后插入3’-UTR

检测原理:

miRNA过表达载体或对照载体、及携带3`-UTRpSL-UTR质粒和含有海肾萤光素酶报告基因(R.Luc)的内参载体(pRL-con-vector)共转染哺乳动物细胞,然后检测萤光素酶表达水平。相对于对照载体,如果miRNA过表达载体使萤火虫荧光素酶表达水平下降,说明miRNA能特异结合该3`-UTR,该基因可能为miRNA的靶基因。

2双荧光素酶(F.Luc/R.Luc)报告基因载体:pdLuc

载体图谱:

pDLuc.bmp

载体特点:

Ø  PGK启动子驱动萤火虫荧光素酶报告基因(F.Luc)的表达,同一载体上另一个报告基因是由SV40启动子控制下的海肾萤光素酶-新霉素基因融合蛋白基因(R.luc-Neo),用于归一化处理和阳性筛选;

Ø  可以用G418进行稳转细胞的筛选;

Ø  3`-UTR多克隆位点是EcoRI-XhoI

检测原理:

    miRNA过表达载体或对照载体、及携带3`-UTRpdLuc-UTR质粒共转染哺乳动物细胞,然后检测萤光素酶表达水平。相对于对照载体,如果miRNA过表达载体使萤火虫荧光素酶表达水平下降,说明miRNA能特异结合该3’-UTR,该基因可能为miRNA的靶基因。

(二) 靶基因UTR产品及服务列表

服务项目:

²  靶基因3’-UTR载体构建:请提供靶基因的名称(GenBank Accession no.),需要克隆的靶基因UTR的范围(大小在0.5 kb以内最为理想,建议不要超过1 kb);选择待克隆的载体。

²  3’-UTR实验分析:分析3’-UTR报告基因活性,鉴定miRNA的靶基因;miRNA过表达质粒可由客户提供或由Geneup公司构建。

3’-UTR突变分析:分析3’-UTR-mut报告基因活性,进一步鉴定miRNA的靶基因。